Tegenover het Joods Historisch Museum ligt de Portugese Synagoge. Dit indrukwekkende gebedshuis uit 1675 is nog bijna helemaal in authentieke staat en wordt nog steeds als synagoge gebruikt. Tijdens de rondleiding besteedt de gids aandacht aan de geschiedenis van de Portugese Joden in Amsterdam en aan de religieuze aspecten van het joodse leven. Onder de bijgebouwen van de synagoge vind je schatkamers vol zilver, goud, brokaat en zijde.
In de synagoge bevindt zich ook de oudste nog functionerende joodse bibliotheek ter wereld: Ets Haim Livraria Montezinos.
De Portugese Synagoge vormt samen met het Joods Museum, het Joods Museum Junior, de Hollandsche Schouwburg en het Nationaalholocaust Museum het Joods Cultureel Kwartier.
Portugese Synagoge in Amsterdam leent zich ook goed voor een schoolreisje. Deze activiteit is geschikt voor volwassenen.